登州古船博物馆位于山东蓬莱旅游区内蓬莱阁东,坐北朝南,1990年建,为仿古园林式建筑,专门展出蓬莱一带从海里打捞出的古船。
博物馆正门为仿古彩绘牌楼,琉璃瓦覆顶,门额“神游”,大门西侧镶嵌“登州古船博物馆”阴刻大理石字碑,东侧镶嵌4方古船航海花岗岩浮雕。
馆内设3个展厅:一展厅置蓬莱水城(古登州港)沙盘和两方PVC显示板,显示板分别显示“登州港古代海内外交通图”和“登州港变迁图”。二展厅展出1984年小海清淤时出土的元代古战船、宋元两代的石碇木碇、明代紫檀木舵杆和古代各类铁锚。三展厅展出小海出土文物79件和明代八年(1375)铸造的铜炮两尊。
1995年登州古船博物馆内共陈列文物100多件,其中一级文物3件,二级文物2件,是国内第二个陈列古船的专题性博物馆。